Геном Pelagibacter ubique – далеко не самый компактный

«По мнению авторов исследования, SAR11 удалось добиться столь впечатляющих успехов в борьбе за место под солнцем главным образом благодаря своей простоте: геном SAR11 состоит из 1,354 генов; меньше – только у самых примитивных вирусов. Их генетический код состоит всего из 1,3 миллионов пар нуклеотидов, а человеческий геном, как известно, состоит из примерно 30 тысяч генов, закодированных в почти трех миллиардах нуклеотидных пар».

(Здесь коллеги, кажется, перегибают палку в погоне за сенсацией.

Среднее число генов в хромосомах бактерий – около трех тысяч. У Mycoplasma genitalium геном состоит всего из 517 генов, и проект «Минимальный геном» http://www.tigr.org/minimal/ под руководством знаменитого Крейга Вентера сейчас пытается минимизировать его до 300, абсолютно необходимых для выживания в лабораторных условиях.

Геном M. genitalium состоит из 580 000 пар нуклеотидов.

А остальное сомнений не вызывает. Но и сенсацией не является :(

Авторы исследования здесь ни при чем: пресс-релиз в EurekAlert озаглавлен просто, скромно и даже банально: «Microbe has huge role in ocean life, carbon cycle» – «Микроб, который играет огромную роль в жизни океана и круговороте углерода». И о размерах генома открытой в 1990 бактерии там говорится скромно: «один из самых компактных».

В русском пересказе заголовки этой новости варьируют от просто броского «Бактерии SAR11 решили проблему мирового господства» (на http://elementy.ru) до извращающего смысл новости «Ученые нашли идеальный геном» (на http://lenta.ru, но там новости науки лучше вообще не читать).

Очищенное от лишних акцентов на идеальном геноме и мировом господстве, сообщение становится только лучше:

Исследователи из Орегонского университета и компании Diversa Corporation утверждают, что крохотные бактерии семейства SAR11 (Pelagibacter ubique) не только преобладают среди живых существ Мирового океана, но также играют значительную роль в углеродном цикле планеты. Бактерия может выживать в виде свободно блуждающей клетки в самых неблагоприятных условиях и способна к репродукции за счет потребления растворенной в воде органики, сообщается в пресс-релизе Орегонского университетаhttp://www.eurekalert.org/pub_releases/2005-08/osu-mhh081805.php

Согласно наблюдениям ученых, опубликованным во вчерашнем номере журнала Science, совокупная масса этих бактерий превышает совокупную массу всех рыб, обитающих в океанах и морях планеты. У берегов Орегона каждый миллилитр океанической воды может содержать до полумиллиона этих созданий. Как утверждает микробиолог Стивен Джованнони (Stephen Giovannoni), у SAR11, в отличие от более развитых существ, не обнаружено признаков дублирующих и неработающих генов (т.н. «мусорной» ДНК). Ее геном – не только самый компактный, но и самый эффективный, где каждый ген служит своей цели, в то время как у человека, напротив, большая часть ДНК – это генетический мусор. Весь ее код сугубо функционален и, в основном, направлен на осуществление главной функции – питания.

Ученые полагают, что именно это преимущество SAR 11 привело к тому, что бактерия стала исключительно успешной. Масса этого вида бактерий по массе превышает совокупную биомассу всех рыб планеты.

Кроме того, Pelagibacter ubique играет исключительно важную роль в химии биосферы. Бактерия потребляет растворенные в океане органические соединения, и производит питательные вещества, необходимые для роста и развития водорослей. Последние, в свою очередь, благодаря происходящему в них процессу фотосинтеза являются источником более 50% кислорода, вырабатываемого всеми растениями Земли.

Кстати, согласно одной из гипотез, принцип естественного отбора может вести не к усложнению жизни, как это принято считать, а наоборот – к ее упрощению, поскольку постоянное воспроизводство лишних ДНК энергетически невыгодно. Как видим, SAR11 является прекрасным подтверждением этой теории.

Интернет-журнал «Коммерческая биотехнология» http://www.cbio.ru/

Страница от 26.04.2024 09:40